Si te pones a usar una aplicación hecha con Qt, o a través de Wine, etc. y ves que los acentos no salen bién, puede que tengas un problema en el método de entrada (input method) que usas.
Solución:
- Abre im-chooser.
- Selecciona el método IBus.
- Si te pregunta si quieres arrancar el demonio IBus, dí que sí.
- Reinicia la sesión.